区司法局设办公室、依法治区秘书股、政工股、法制股、行政复议与应诉股、社区矫正管理局、公共法律服务管理股（法律援助中心）共7个内设机构，各股室具体职能职责如下：

办公室负责政务、文秘、档案、保密、内宣、目标管理、信息化基础建设、机关安全等工作。

依法治区秘书股负责依法治区重大问题的政策研究和重大决策部署督察、指导依法治理和法治创建、组织对外法治宣传等工作。

政工股负责纪检监察、外宣、精神文明建设和行风建设、队伍建设、干部人事、离退休人员服务管理、教育培训、表彰奖励、深化改革、工会、群团等工作。

法制股负责规范性文件的合法性审查、清理、报送备案和备案审查、依法行政、法治政府建设等工作。

行政复议与应诉股负责行政执法监督检查和执法人员资格审核、指导行政复议和行政应诉等工作。

社区矫正管理执法大队负责指导、管理社区矫正、刑满释放人员帮教安置等工作。

公共法律服务管理股（法律援助中心）负责公共法律服务体系建设、指导管理律师、法律援助、公证、基层法律服务、人民调解和基层司法所等工作。